Research press release

ウイルス学:SARS-CoV-2関連コロナウイルスが東南アジアに生息するコウモリとセンザンコウから見つかった

Nature Communications

Virology: SARS-CoV-2-related coronaviruses found in bats and pangolins in Southeast Asia

タイ東部の野生生物保護区に生息するコウモリから重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)関連コロナウイルスが検出された。このコウモリとタイ南部の野生動物検問所で得られたセンザンコウは、SARS-CoV-2を中和する抗体を保有していることが分かった。以上の知見は、コウモリとセンザンコウに由来するSARS-CoV-2関連コロナウイルスの存在を確認できる地理的領域を拡大する。こうした結果について報告する論文が、Nature Communications に掲載される。

SARS-CoV-2の起源と中間動物宿主の役割は、まだ完全に解明されていない。これまでにSARS-CoV-2にごく近縁なコウモリ由来コロナウイルス(特にSARS-CoV-2ゲノムとの塩基配列一致率が96%のRaTG13と93.6%のRmYN02)が中国で発見されており、SARS-CoV-2が動物から出現したことが示唆されていた。SARS-CoV-2関連コロナウイルスは、日本のコウモリと中国のセンザンコウから採取した試料でも検出されたことが報告されているが、直近の前駆ウイルスと中間動物宿主は、いまだに明らかになっていない。

今回、Lin-Fa Wangたちが実施したコロナウイルスのサーベイランス調査で、タイ東部の野生生物保護区の人工洞窟から採取した5匹のトガリキクガシラコウモリ(Rhinolophus acuminatus)がSARS-CoV-2にごく近縁なコロナウイルスを保有することが明らかになった。この分離されたウイルスは、RacCS203と命名され、SARS-CoV-2とのゲノム類似性が91.5%で、RmYN02にもごく近縁だった。また、スパイクタンパク質の受容体結合ドメイン(RBD)の配列解析とACE2との結合実験を行った結果、RacCS203がヒトACE2受容体を用いて宿主の細胞に侵入できないことが示唆された。そして、同じコロニーに属する複数のコウモリとタイ南部の野生動物検問所で得たセンザンコウからSARS-CoV-2中和抗体が検出され、東南アジアでSARS-CoV-2関連コロナウイルスが流行していることを示す証拠が得られた。

今回の調査のサンプルサイズが小さく、対象地域も限定されているものの、Wangたちは、多くの国と地域に生息するコウモリがSARS-CoV-2関連コロナウイルスを保有している可能性があると予測している。今回の知見はSARS-CoV-2の起源を特定するものではないが、SARS-CoV-2に近縁なウイルスが検出された地域が、約4800 kmの範囲に拡大した。

A coronavirus related to SARS-CoV-2 has been detected in bats from a wildlife sanctuary in eastern Thailand, reports a study in Nature Communications this week. Bats from this location, as well as a pangolin sampled from a wildlife checkpoint in southern Thailand, are shown to harbour antibodies that are able to neutralize SARS-CoV-2. These findings expand the geographical regions where SARS-CoV-2-related coronaviruses from bats and pangolins are found.

The origins of SARS-CoV-2 and the role of intermediate animal hosts have not yet been fully determined. The previous discovery of closely related coronaviruses from bats in China (notably RaTG13 and RmYN02, sharing 96% and 93.6% genome sequence identity with SARS-CoV-2, respectively) has suggested an animal origin for the emergence of SARS-CoV-2. Related coronaviruses have also been reported in samples from bats in Japan and pangolins in China, but immediate progenitor viruses and intermediate animal hosts have remained elusive.

Coronavirus surveillance investigations carried out by Lin-Fa Wang and colleagues identify a close relative to SARS-CoV-2 in five acuminate horseshoe bats (Rhinolophus acuminatus) from an artificial cave in a wildlife sanctuary located in Eastern Thailand. The isolated virus, named RacCS203, exhibits 91.5% genome similarity to SARS-CoV-2 and it is also closely related to RmYN02. Sequence analysis of the receptor binding domain of the Spike protein, coupled with ACE2 binding studies, suggest that RacCS203 is unable to use the human ACE2 receptor to enter host cells. The detection of SARS CoV-2 neutralizing antibodies in bats of the same colony and in a pangolin at a wildlife checkpoint in southern Thailand also provides evidence for the circulation of SARS-CoV-2-related coronaviruses in Southeast Asia.

The authors note that their sample size and area is limited, but they predict that SARS-CoV-2-related coronaviruses may be present in bats across many nations and regions in Asia. Although these findings do not pinpoint the origins of SARS-CoV-2, they extend the area in which SARS-CoV-2 relatives have been detected to a distance of around 4,800km.

doi: 10.1038/s41467-021-21240-1

「Nature 関連誌注目のハイライト」は、ネイチャー広報部門が報道関係者向けに作成したリリースを翻訳したものです。より正確かつ詳細な情報が必要な場合には、必ず原著論文をご覧ください。

メールマガジンリストの「Nature 関連誌今週のハイライト」にチェックをいれていただきますと、毎週最新のNature 関連誌のハイライトを皆様にお届けいたします。

「注目のハイライト」記事一覧へ戻る

プライバシーマーク制度