Brief Communication

ガスクロマトグラフィー質量分析データの自動デコンボリューションおよび分子ネットワーキング

Nature Biotechnology 39, 2 doi: 10.1038/s41587-020-0700-3

今回我々は、ガスクロマトグラフィー質量分析(GC–MS)データの自動デコンボリューションを可能とする機械学習法MSHubを考案した。さらに我々は、研究者たちがGlobal Natural Product Social (GNPS) Molecular Networkingの解析プラットフォーム内でGC–MSデータの分子ネットワーキングの保存、処理、共有、アノテーション、比較、実行することを可能とするワークフローを設計した。MSHub/GNPSは、教師なしの非負行列因子分解による化合物断片化パターンの自動デコンボリューションを行い、試料全体の断片化パターンの再現性を定量化する。

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