Brief Communication

scCOLOR-seqによる単一細胞トランスクリプトームのナノポア塩基配列解読

Nature Biotechnology 39, 12 doi: 10.1038/s41587-021-00965-w

本論文では、バーコードおよび固有分子識別子のオリゴヌクレオチド配列の誤りを訂正することができ、単一細胞の独立型cDNAナノポア塩基配列解読を可能とするscCOLOR-seq(single-cell corrected long-read sequencing)を紹介する。バーコードおよび固有分子識別子は、誤りの検出を可能とする二量体ヌクレオチドの構成要素を用いて合成される。我々は、バーコードの割り当ての正確度の評価、骨髄腫細胞株での差次的なアイソフォームの使用、肉腫細胞株での融合転写物の検出にこの方法が使用できることを示した。

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