3,000 라이스 지놈 프로젝트에 참여하고 있는 Zhikang Li, Kenneth McNally, Rod Wing, 그리고 공동연구원들은 아시아지역에서 재배되고 있는 쌀 품종인 Oryza sativa L.의 변이종 3,010개에 대한 전체 지놈 염기서열을 분석하였다. 저자들은 O. sativa의 지놈 다양성과 개체집단 구조를 분석하였으며, 펜-지놈을 구성하였다. 저자들의 분석 결과를 통해서 쌀에 대한 종 내부에서의 다양성, 진화 히스토리, 그리고 재배 히스토리에 대한 보다 상세한 정보를 제공할 수 있게 되었다. 또한 저자들은 쌀알의 길이, 폭, 그리고 세균에 의한 마름병에 대한 저항성과 관련된 전체 지놈 연관성에 대한 맵핑에 자신들의 결과를 이용하는 방법을 제시하였다.