프라이머 결합과정에서 일어나는 tRNA와 레트로바이러스 RNA 리모델링의 구조기반 메커니즘 분석

레트로바이러스는 감염 후 첫 단계의 전사를 위해서 숙주의 특정 tRNA를 이용한다. MLV(Moloney Murine Leukaemia virus)는 레트로바이러스 RNA의 두 영역(U5-PSB 및 PAS)에 결합하는 tRNApro를 이용한다. Victoria D’Souza와 공동연구원들은 프라이밍 프로세스의 한 부분으로 U5-PBS RNA와 tRNA 프라이머에 어떤 리모델링 현상이 나타나는지를 이해하기 위해서, 이들이 뉴클레오캡시드 단백질과 결합하거나, 결합하지 않은 상태의 NMR 구조를 분석한 연구 결과를 발표하였다. RNA의 부위와 약한 친화성으로 결합하는 다른 ATP-비의존성 뉴클레오캡시드 샤페론과는 달리, 레트로바이러스 단백질은 엔트로피에 의한 캡처-릴리즈 리모델링 메커니즘을 이용하며, 아주 적은 부위들이 높은 친화성으로 결합한다는 사실을 확인할 수 있었다. 이러한 결과를 통해서 지역적인 불안정화가 분자간 상호작용을 하는데 필수적으로 요구된다는 사실을 확인할 수 있었다.