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계통분류학적 기준에 따른 세균 및 고세균 지놈 염기서열 분석

Nature 462, 7276

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지금까지 지놈 염기서열이 분석된 세균과 고세균은 생리학적 특징을 바탕으로 선택되었다. 이러한 선택 방식도 좋지만, 결과적으로는 계통분류학적 치우침(phylogenetic bias)이 발생하게 된다. GEBA 프로젝트(Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea project)에서 대안적인 접근 방식이 시도되었다. 새로운 접근 방식에서는 염기서열을 분석할 지놈을 선택하는 기준을 todanf 종의 계통 분류학적 위치에 근거하여 선택함으로써 생명의 나무에서 세균과 고세균 가지 상의 갭을 채우는 것을 목표로 하고 있다. 이러한 접근 방식의 가치는 계통분류학적 커버리지를 극대화 하기 위하여 선택된 배양 가능한 56종의 지놈 염기서열 분석에 대한 파일럿 연구(pilot study)를 통해서 증명되었다. 염기서열에 대한 분석 결과는 계통분류학, 단백질 기능, 그리고 지놈 주석 달기(genome annotation)에 대한 통찰을 제공하였다.

Letter p.1056
doi | 10.1038/nature08656 | 전문   | PDF

2009년12월24일 자의 네이처 하이라이트