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WashU Virus Genome Browserを用いたコロナウイルスパンデミックの探索

Nature Genetics 52, 10 doi: 10.1038/s41588-020-0697-z

WashU Virus Genome Browserは、ウイルスの「オミックス」データを効率的に可視化するためのウェブポータルサイトである。さまざまなアノテーショントラックを備え、宿主の感染応答という点に着目したデータが見られる。ブラウザは、系統樹ベースの画面表示と、ゲノム座標のトラックベースの画面表示の両方を備えており、ユーザーはウイルスゲノムの塩基配列の特徴、ウイルス株間の塩基配列多様性、診断検査のためのゲノム部位、予測される免疫原性エピトープ、公開ゲノムデータセットの最新更新レポジトリを解析することができる。

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