AlphaFoldの予測構造データベースから得られた新知見
タンパク質のβバレルと呼ばれる構造。 Credit: Laguna Design/Science Photo Library
タンパク質「宇宙」の闇に光が当てられた。グーグル・ディープマインド社（英国ロンドン）は2022年、革新的なAlphaFoldニューラルネットワークを駆使して、ゲノム塩基配列が知られている生物の既知のタンパク質の構造をほぼ全て予測し、約2億1400万件のエントリーからなるデータベースを構築した。このデータベースは欧州バイオインフォマティクス研究所（英国ヒンクストン）が管理していて、誰でも自由に利用できる。今回、この情報資源を活用した2つの研究によって、遠縁のタンパク質間の予想外の構造的関連や、全く新しい構造など、数年前には想像もできなかったような知見が得られた1,2。
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翻訳：藤山与一
原文
‘A Pandora’s box’: map of protein-structure families delights scientists- Nature (2023-09-13) | DOI: 10.1038/d41586-023-02892-z
- Ewen Callaway
参考文献
- Barrio-Hernandez, I. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-023-06510-w (2023).
- Durairaj, J. et al. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-023-06622-3 (2023).