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RNA AtlasがヒトノンコーディングRNAのカタログを拡張する

Nature Biotechnology 39, 11 doi: 10.1038/s41587-021-00936-1

ノンコーディングRNA(ncRNA)に関する既存の目録は、ほぼ小分子のポリアデニル化RNAのみに由来することも手伝って、不十分なものとなっている。本論文では、ヒトトランスクリプトームに関するより包括的なアトラスを紹介する。これには、小分子のポリA付加RNAにとどまらず、300種類のヒト組織と細胞株の全RNAが含まれる。過去に特性評価が行われていない数千のRNAが明らかになり、記載されているncRNAの数は約8%増加した。既知のncRNAと新規に特性評価されたncRNAによる機能の調節を推測するために、我々は、全RNA塩基配列解読からのプレmRNA存在量の推定値を利用して、タンパク質コード遺伝子と経路の調節での役割に関して複数の証拠を有する316のマイクロRNAと、3310の長鎖ノンコーディングRNAを見いだした。本研究は、ヒトncRNAとその調節的相互作用に関する従来のカタログを改良するとともに拡張した。全てのデータ、解析、結果は、R2ウェブポータルでダウンロードして得ることが可能であり、RNAの生物学と機能に関する今後の研究の基盤となる。

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