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コロナウイルス:南アフリカでSARS-CoV-2の懸念される変異株を検出

Nature 592, 7854 doi: 10.1038/s41586-021-03402-9

世界の多くの地域で、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の制御不能な伝播が続いており、このウイルスに大きな進化的変化をもたらす状況が生じている。今回我々は、新たに発生したSARS-CoV-2系統(501Y.V2と命名;別名B.1.351あるいは20H)について報告する。この系統はスパイクタンパク質中の8つの変異で定義され、これらの変異には、機能的に重要だと考えられている受容体結合ドメインの残基の3つの置換(K417N、E484K、N501Y)を生じるものが含まれる。この系統は、南アフリカ東ケープ州沿岸部に位置する、深刻な被害を受けた大都市圏(ネルソン・マンデラ・ベイ)で、エピデミックの第一波後に見つかった。501Y.V2変異株は急速に広がり、数週間の内に東ケープ州、西ケープ州、クワズール・ナタール州で優勢となった。これらの変異が何を意味するかはまだ完全には明らかにされていないが、ゲノムデータは、複数の地域で、501Y.V2変異株が急速に拡散して他の系統と置き換わったことを示しており、この系統が選択優位性と関連していることが示唆された。この選択優位性は、伝播性の上昇や免疫逃避の結果と考えることが最も妥当である。

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