사람 조직 및 세포 종류에 따른 활성화 인헨서의 전체 지도 분석

FANTOM5(Functional annotation of the mammalian genome 5)는 모든 종류의 사람 세포를 대상으로 전사 조절 네트워크를 분석하기 위한 5번째 국제 협력이다. 이번 주 네이처에 게재된 두 편의 연구 논문에서는 FANTOM5 프로젝트의 최근 연구 성과에 대한 내용이 발표되었다. 첫 번째 연구 논문에서는 조직에 대한 FANTOM5 패널과 1차 배양 세포 샘플을 통해서 in vivo에서 양 방향으로 전사되는 인헨서에 대한 지도를 제작하였다. 저자들은 양 방향으로 캡을 가진 RNA가 활성화된 인헨서의 특징이며, 800개의 인간 세포와 조직 샘플로부터 40,000개 이상의 인헨서를 밝힐 수 있었다. 이러한 인헨서 지도는 서로 다른 세포 종류 간의 조절 프로그램을 비교하고, 질병과 관련된 조절 SNP를 확인하며, 세포 특이적인 인헨서를 연구하는데 이용될 수 있을 것으로 판단된다. 두 번째 연구 논문에서는 단일 분자 염기서열 분석을 이용하여 사람과 생쥐의 전사 개시 부위의 지도와 이들이 어떻게 이용되는지를 지금까지 포유류 유전자 발현에 대한 지도가 가장 잘 만들어져 있는 사람 세포 패널과 생쥐 1차 배양 세포 샘플, 세포주와 조직 샘플로부터 확보한 연구 결과가 발표되었다. 이번 연구 결과를 통해서 ORF(open reading frame)과 프로모터에 대한 과도한 정보를 확보할 수 있었으며, 서로 다른 세포 종류와 포유류 세포 종류에 따른 특이적인 트랜스크립톰을 확인할 수 있었다.