효모에서 단백질의 발현 레벨 차이에 대한 단일 세포 단위 분석

다양한 DNA 변이는 하나 또는 여러 유전자의 발현 레벨을 변화시킴으로써 표현형에 영향을 주기 때문에, 최근에는 이러한 발현 정량 특성 유전자 위 (expression quantitative trait loci, eQTL)을 맵핑하기 위한 관심이 커지고 있다. 이번 주 네이처에 발표된 연구 논문에서는 eQTL 맵핑을 위한 새로운 방법이 발표되었는데, RNA 또는 단백질의 양에만 초점을 맞췄던 기존 분석 방법을 극복할 수 있는 디자인이 적용되었다. 새로운 접근 방법은 GFP 테그를 이용하여, 단일 세포 단백질의 양을 Saccharomyces cerevisiae에서 측정하였다. 한데 모아진 염기서열은 높거나 낮은 단백질 양에 따라서 수천 개체 간에서 지놈 상의 유전자 위 빈도를 비교하는데 이용되었다. 저자들은 mRNA와 단백질의 양에 영향을 주는 유전자위 간의 일치성에 대해 보고하였으며, 다양한 단백질에 영향을 주는 핫스팟을 찾은 결과도 보고하였다. 이러한 핫스팟은 유전자 조절 네트워크에 큰 영향을 주는 것으로 확인되었다.