환경 내에 존재하는 미생물 게놈 분석을 통한 미생물 개체군 분석

환경 내에 존재하는 배양되지 않는 세균에 대한 염기서열 분석이 포함된 새로운 연구결과를 통해서 실험실에서 배양되지 않는 세균에 대한 연구에 지노믹스(genomics)가 매우 유용하게 이용될 수 있다는 사실이 제시되었다. 캘리포니아에 위치한 아이언 마운틴(Iron Mountain)의 수백미터 지하에 위치하고 있는 리치몬드 황철광 광산(Richmond pyrite ore mine)에서 흘러 나오는 강산성의 물은 바이오 필름으로 불리는 미생물 집락을 함유하고 있다. 바이오 필름은 극한 환경에 내성을 가진 다양한 미생물들로 구성된 세균(bacteria)과 고세균들(archaea)로 이루어져 있다. 게놈 염기서열 분석을 통해서 이 바이오 필름이 세균인 Leptospirillum과 고세균인 Ferroplasma로 구성되어 있다는 사실을 알 수 있었다. 두 미생물들은 탄소 및 질소 고정과 에너지 생산, 그리고 극한 환경에서 생존하기 위해 필요한 다양한 유전자들을 가지고 있었다. 환경 지놈에 대한 이번 기초 연구를 통해서 바이오 필름에 단지 몇 몇 종의 세균만이 존재하고 있다는 사실을 뒷받침할 수 있게 되었으며, 미생물 종들간에 일어난 대부분의 변이는 단일 염기 서열 변이인 것으로 나타났다.