RNA 구조 예측 알고리즘

염기 서열로부터 RNA 구조를 예측하는 것은 매우 어려운데, 이는 구아닌과 우라실의 결합과 같은 ‘비-왓슨-크릭’ 염기쌍이 나타나기 때문이다. 이러한 미스 매치(mismatch)는 RNA의 구조적인 안정성에 관여하는 것으로 여겨진다. 세포 내 조절에 있어서 작은 RNA 분자가 가지는 중요성이 명확해지면서, RNA 구조를 측정할 수 있는 보다 효과적인 방법에 대한 요구가 시급하다. Marc Parisien과 Francois Major는 염기서열로부터 RNA 구조를 측정할 수 있는 놀라운 기술적인 진보를 가져온 일련의 알고리즘에 대한 연구 결과를 발표하였다. 이러한 알고리즘에서는 3차원 구조를 만들기 위해서 가능한 모든 염기쌍을 계산에 이용하고 있다. 분석 결과는 바닥 상태의 구조뿐만 아니라, 다른 가능한 구조를 나타내는 것이 가능하다.