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리서치 하이라이트

유전자 발현지도 제작

Nature 576, 7785

이 연구에서 Nikolaus Rajewsky와 그의 동료들은 단일 세포의 유전자 발현 프로파일에서 유사성에 기초하여 조직에서 세포의 공간적 조직을 유추하는 데 사용되는 컴퓨터를 이용한 새로운 framework (novoSpaRc)를 발표하였다. 이 방법은 근접한 공간에 존재하는 세포들은 유사한 전사 프로파일을 공유할 것이라는 가정을 기반으로 하고 있으며, 저자들은 이를 보다 복잡한 Zebrafish와 초파리 배아와 더불어 소장 상피 및 간 소엽과 같은 단순한 1차원 구조를 포함한 기존 단일 세포 시퀀싱 데이터 세트에 적용하였다. 또한 저자들은 재구성된 조직이 알려졌거나 잠재적으로 알려지지 않은 공간적으로 유익한 유전자 모두를 식별하여 복합 조직의 공간적 조직에 기여할 수 있는 유전자의 목록을 확장시키는 데 사용될 수 있음을 보여준다.