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6億種類のタンパク質の構造を予測したメタのAI

ESM Metagenomic Atlasには、6億1700万種類のタンパク質の構造の予測結果が収録されている。 Credit: CHRISTOPH BURGSTEDT/SCIENCE PHOTO LIBRARY/Getty

2022年7月、ディープマインド社(DeepMind、英国ロンドン)が、タンパク質構造予測AI「AlphaFold」を用いて約2億2000万種類のタンパク質の構造を予測したことを発表した(2022年11月号「AlphaFoldの潜在能力を最大限引き出すには」参照)。これにより、DNAデータベースに収録されている既知の生物のほぼ全てのタンパク質がカバーされた。そしてこのほど、もう1つの巨大IT企業メタ(Meta:旧フェイスブック、米国カリフォルニア州メンロパーク)が、タンパク質の宇宙の「ダークマター(暗黒物質)」部分の探索に乗り出した。同社の研究者たちはAIを使って、細菌やウイルスなどの微生物に由来する、特性が未解明のタンパク質約6億種類の構造を予測したのだ。

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翻訳:三枝小夜子

Nature ダイジェスト Vol. 20 No. 2

DOI: 10.1038/ndigest.2023.230211

原文

AlphaFold’s new rival? Meta AI predicts shape of 600 million proteins
  • Nature (2022-11-01) | DOI: 10.1038/d41586-022-03539-1
  • Ewen Callaway

参考文献

  1. Lin, Z. et al. Preprint at bioRxiv https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.07.20.500902v2 (2022).
  2. Lin, Z. et al. Preprint at bioRxiv https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.07.20.500902v1 (2022).
  3. Weissenow, K., Heinzinger, M. & Rost, B. Structure 30, 1169–1177 (2022).